ORTADOĞU TIP DERGİSİ - ORTADOGU MEDICAL JOURNAL

Search Results

Keyword: duyarlılık

Research Article

Serotyping strains of Haemophilus influenzae isolated from clinical specimens and investigating their susceptibilities towards certain antimicrobials

Klinik örneklerden izole edilen Haemophilus influenzae suşlarının serotiplendirilmesi ve bazı antimikrobiyallere duyarlılık durumlarının araştırılması

Demet Hacıseyitoğlu, Bülent Sümerkan

Ortadogu Tıp Derg, Volume 11, Issue 4, pp. 497-503

DOI: https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.544493

Abstract Article (PDF)

ABSTRACT

Aim: Haemophilus influenzae is an agent of severe pediatric infections, and a significant cause of mortality and morbidity in children. Its capsulated strains are grouped from ‘a’ to ‘f’ in six groups, the most invasive among which is Type B. The other serotypes are also capable of causing severe infections and invasive diseases. Antibiotic sensitivity testing proves to be useful in directing course of treatment in view of the beta-lactamase-negative and ampicillin-resistant strains as well as the ever-increasing production of beta-lactamase.
In this study it has been aimed to serotype Haemophilus influenzae strains isolated from various clinical specimens, and to investigate their status of beta-lactamase production and susceptibilities towards antimicrobials.
Materials and Methods: 100 samples of H. influenzae proliferating in various clinical specimens were included in the study. The bacteria were identified according to their requirements of X and V factors, or through the usage of API NH. Detection of beta-lactamase production was made with nitrocefin disks. Serotyping was performed via slide agglutination method with specific antiserums. Susceptibilities towards various antimicrobials were specified with gradient test in Haemophilus Test Medium.
Results: 59 of the specimens were sputum, 23 were nasotracheal aspirates, 3 were bronchoalveolar lavages, 7 were middle ear fluids, 3 were cerebrospinal fluids, 2 were eye fluids, 2 were pleural fluids, and 1 was a blood sample. The ranking was made without keeping age groups in regard and turned out as a>b>d>THi>c>e. Serotype f was not found among the strains. Type b was isolated from all of sterile body cavity fluids. Beta-lactamase positivity was found as 2% and the BLNAR ratio was found as 2%. All were found as susceptible towards cefotaxime and siprofloxacin while 66.6% were susceptible towards azithromycin, and 93% were susceptible towards TMP-SMX.
Conclusion: It will be appropriate to perform standardized susceptibility tests in routine in order to monitor antimicrobial resistance. Serotyping is important as inclusion of H. influenzae type b in vaccination programs may cause an increase in infections with non-Hib isolates.

Keywords: H.influenzae, serotyping, antimicrobial susceptibility

ÖZ

Amaç: Çocuklarda, ciddi enfeksiyonların etkeni olan Haemophilus influenzae, önemli bir mortalite ve morbidite nedenidir. Kapsüllü suşları a’dan f’ye kadar 6 gruptur. İçlerinde tip b en invaziv olanıdır. Diğer serotipler de ciddi enfeksiyonlar ve invaziv hastalıklara yol açabilir. Giderek artan beta laktamaz üretimi ve beta laktamaz negatif olup ampisilin dirençli suşlar nedeniyle antibiyotik duyarlılık testi tedavinin yönlendirilmesi açısından yararlı olmaktadır.
Bu çalışma ile çeşitli klinik örneklerden izole edilen H. influenzae suşlarının serotiplendirilmesi, beta laktamaz üretimi ve antimikrobiyallere duyarlılık durumunun araştırılması amaçlanmıştır.
Gereç ve Yöntemler: Çeşitli klinik örneklerde üreyen 100 H. influenzae çalışmaya alındı. Bakteriler X ve V faktörü ihtiyacına bakılarak veya API NH kullanılarak tanımlandı. Beta laktamaz üretimi, nitrosefin diskleriyle araştırıldı. Serotiplendirme, spesifik antiserumlarla lam aglütinasyon yöntemiyle yapıldı. Çeşitli antimikrobiyallere duyarlılıkları, Haemophilus Test Medium’da gradient testle belirlendi.
Bulgular: Örneklerin 59’u balgam, 23’ü nazotrakeal aspirat, 3’ü bronkoalveoler lavaj, 7’si orta kulak sıvısı, 3’ü beyin omurilik sıvısı, 2’si göz, 2’si plevra sıvısı ve 1’i kan idi. Yaş grupları dikkate alınmaksızın yapılan sıralamada a> b> d> THi> c> e idi. Suşlar arasında serotip f bulunamadı. Steril vücut boşluğu sıvılarının hepsinden tip b izole edildi. Beta laktamaz pozitifliğinin %2 ve BLNAR oranının %2 olduğu bulundu. Hepsi sefotaksime ve siprofloksasine duyarlı, %66,6’sı azitromisine ve %93’ü TMP-SMX’e duyarlıydı.
Sonuçlar: Antimikrobiyal direnci izlemek amacıyla standardize duyarlılık testlerinin rutinde yapılması uygundur. H.influenzae tip b’nin aşılama programlarına alınması Hib dışı izolatlarla enfeksiyonlarda artışa yol açabileceğinden serotiplendirme yapılması önemlidir.

Keywords: H.influenzae, serotiplendirme, antimikrobiyal duyarlılık

Research Article

Investigation of cardiac markers cut off values in the diagnosis of acute coronary syndrome

Akut koroner sendrom tanısında kardiyak belirteçlerin kesme değerlerinin incelenmesi

Mustafa Şahin, Mehmet Kabalcı, Ünsal Savcı

Ortadogu Tıp Derg, Volume 10, Issue 3, pp. 247-251

DOI: https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.353568

Abstract Article (PDF)

ABSTRACT

Aim: The number of patients applying to the emergency service with acute chest pain complaint are rather high, however most of them are not diagnosed with acute coronary syndrome (ACS). Firstly non-cardiac causes should be excluded to be able to determine true cardiac patients. Troponins are structural proteins of the cardiac muscle, also sensitive and specific molecules of cardiac damage. In this study, we aimed to determine cut off value of Creatine kinase MB (CKMB) test for ACS diagnosis by using cardiac troponin T (cTnT) results and ROC analysis. We also evaluated the combined use of cardiac markers and clinical finding in acute myocardial infarction (AMI) patient management.
Material and Method: Laboratory and clinical data, including electrocardiography (ECG) and cardiac markers (cTnT, CKMB levels) of 390 patients applying to emergency service with acute chest pain were retrospectively collected and attempted to develop a strategy using these data. The cases (age: 58.65±13.29) were divided into two groups: first group AMI and second group non-ischemic injury. CKMB levels were measured by the immunoinhibition method in Dimension Xpand Plus (Dade Behring Inc, Newark, USA) chemistry autoanalyzer. The Cardiac T Quantitative Rapid Assay (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Germany) was used for cTnT measurement.
Result: In our study, AMI was detected in 36 of 390 patients (9.2%). In prediction of AMI, the diagnostic specificity and diagnostic sensitivity of CKMB was 92% and 44% for 16 U/L; 86% and 50% for 12 U/L; 79% and 61% for 9 U/L, 63% and 69% for 6 U/L, respectively. The area under the curve for CKMB was 0.72 (SE: 0.055, p <0.001).
Conclusion: Although cTnT is the most important marker in early diagnosis of AMI in emergency department, CKMB levels are a reliable marker that should be used together to reduce both false negative and false positives.

Keywords: Acute coronary syndrome, cardiac troponin, creatine kinase MB, sensitivity, specificity

ÖZ

Amaç: Akut göğüs ağrısı şikâyeti ile acil servise başvuran hasta sayısı oldukça fazladır ancak bunların çoğu akut koroner sendrom (AKS) tanısı almaz. Gerçek kardiyak hastaları belirleyebilmek için ilk aşamada non-kardiyak nedenleri dışlamak gerekir. Troponinler, kalp kasının yapısal proteinleri olup kardiyak hasara duyarlı veözgün molekülleridir. Bu çalışmada AKS tanısı için Kreatin kinaz MB (CKMB) testinin kesme değerini kardiyak troponin T (cTnT) sonuçlarından ve ROC analizinden faydalanarak belirlemeyi amaçladık. Ayrıca akut miyokard infarktüsü (AMI) hasta yönetiminde kardiyak belirteçlerin ve klinik bilgilerin birlikte kullanımını değerlendirdik.
Gereç ve Yöntem: Akut göğüs ağrısı ileacil servise başvuran 390 hastanın elektrokardiyografi (EKG) ve kardiyak belirteçler (cTnT, CKMB seviyeleri) de dâhil olmak üzere laboratuvar ve klinik verileri retrospektif olarak toplandı ve bu veriler kullanılarak bir strateji geliştirmeye çalışıldı. Olgular (yaş:58.65 ± 13,29) iki gruba ayrıldı: birinci grup AMI ve ikinci grup iskemik hasar olmayanlardı. CKMB seviyeleri Dimension Xpand Plus (Dade Behring Inc, Newark, ABD) marka biyokimya otoanalizöründe immünoinhibisyon yöntemiyle ölçüldü. cTnT için Cardiac T Quantitative Rapid Assay (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Almanya) hasta başı cihazı kullanıldı.
Bulgular: Çalışmamızda 390 hastanın 36'sında (% 9,2) AMI saptandı. AMI öngörmede CKMB'nin tanısal özgüllüğü ve tanısal duyarlılığı, 16 U/L düzeyi için %92 ve %44; 12 U/L düzeyi için %86 ve %50; 9 U/L düzeyi için %79 ve %61; 6 U/L düzeyi için%63 ve%69 olarak bulundu. CKMB için eğri altındaki alan 0,72 (SE:0,055, p<0,001) idi.
Sonuç: Acil serviste AMI erken teşhisinde her ne kadar cTnT en önemli marker olsa da CKMB düzeyleri de hem yalancı negatifliği hem de yalancı pozitifliği azaltmak için birlikte kullanılması gereken güvenilir bir markerdir.

Keywords: Akut koroner sendrom, kardiyak troponin, kreatin kinaz MB, duyarlılık, özgüllük

Research Article

The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients

Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları

Nilgün Altın, Salih Cesur, Göknür Yapar Toros, Kamer Koldaş, Gülkan Solgun, İrfan Şencan

Ortadogu Tıp Derg, Volume 10, Issue 2, pp. 130-134

DOI: https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948

Abstract Article (PDF)

ABSTRACT

Aim: The infections caused by candida species are important causes of mortality in intensive care unit (ICU) patients. In this study, we aimed to determine the distributions of candida species and the susceptibilities of these organisms to amphotericin B, flucanazole, flucytosine, and varicozanole retrospectively, which were isolated from various clinical samples of ICU patients at Etlik Education and Research Hospital.
Materials and Method: In this study, a total of 51 Candida species were included that were isolated from urine (n=46, 90%), blood (n=2, 4%), bronchoalveolar lavage fluid (n=2, 4%) and wound cultures (n=1, 2%) of ICU patients between January 2011 and January 2012. Candida species were identified by germ tube test and VITEK 2 Compact System (BioMerieux, France) automatized identification system and their antifungal susceptibilities were determined.
Results: Of these 51 candida species; 26 (51%) were C. albicans, 7 (14%) were C. tropicalis, 5 (10%) were C. parapsilosis, 4 (8%) were C. glabrata, 3 (6%) were C. lusitaniae, 3 (6%) were C. Krusei, 2 (4%) were C. famata and 1 (2%) was C. kefyr. Forty-nine (98%) candida species were investigated for antifungal susceptibility. For flucytosine, 47 (95.9%) species were sensitive whereas 2 C. krusei species were moderately sensitive. For fluconazole, 42 species (85.7%) were sensitive, 6 species (3 C. krusei, 3 C. glabrata) were resistant, and 1 species (C. galibrata) was moderately sensitive. For voricanazole, 48 species (98%) were sensitive, and 1 C. glabrata species was resistant. For amphotericin B, 45 species (91.8%) were sensitive and 4 species (2 C. krusei, 2 C. glabrata) were moderately sensitive.
Conclusion: In intensive care unit patients, identification of Candida species and determination of antifungal susceptibilities is necessary for planning both empirical and agent specific antifungal therapy.

Keywords: Intensive care unit, candida species, antifungal susceptibility

ÖZ

Amaç: Candida türlerine bağlı infeksiyonlar yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda mortalitenin önemli bir nedenidir. Bu çalışmada, Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitesinde yatan hastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen candida türlerinin dağılımının ve amfoterisin B, flukonazol, flusitozin ve vorikonazol duyarlılıklarının retrospektif olarak belirlenmesi amaçlandı.
Gereç ve Yöntem: Çalışmada Ocak 2011- Ocak 2012 tarihleri arasında Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitesi’nde yatan hastaların 46 idrar (90.2), 2 kan (%4 ), 2 (%4)bronkoalveoler lavaj sıvısı ve 1 (%2) yara kültüründen izole edilen toplam 51 Candida suşu çalışmaya alındı. Candida suşları germ tüp testi ve VITEK 2 Compact System (BioMerieux,Fransa) otomatize identifikasyon sistemi ile tanımlandı ve antifungal duyarlılıkları belirlendi.
Bulgular: Toplam 51 Candida suşunun 26 (%51)’sı C.albicans, 7 (%14)’si C. tropicalis, 5 (%10 )’i C. parapsilosis, 4 (%8)’ü C.glabrata, 3 (%6)’ü C. lusitaniae, 3 (%6)’ü C. krusei, 2(%4)’si C. famata ve 1 (%2)’i C.kefyr olarak belirlendi. Kırkdokuz (%96) Candida suşunda antifungal duyarlılık araştırıldı. Flusitozin 47 suşta (%95.9) duyarlı iken, 2 tane C.krusei suşunda orta duyarlı idi. Flukonazol 42 suşta (%85.7) duyarlı iken, 6 suşta dirençli (3’ü C. krusei, 3’ü C.glabrata ), 1 C.glabrata suşunda ise orta duyarlı idi. Vorikonazol 48 suşta (%98) duyarlı iken, 1 C. glabrata suşunda dirençli idi. Amfoterisin B 44 suşta (%90) duyarlı iken, 4 suşun (2’si C. krusei, 2’si C. glabrata) orta duyarlı olduğu tespit edildi.
Sonuç: Yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda Candida türlerinin sıklığının ve antifungal duyarlılıklarının saptanması hem ampirik antifungal tedavinin planlanması hem de etkene spesifik antifungal tedavinin belirlenmesi açısından gereklidir.

Keywords: Yoğun bakım ünitesi, candida türleri, antifungal duyarlılık

Research Article

Assessment of Pseudomonas aeruginosa resistance profiles in intensive care units: Five-year outcomes

Yoğun bakım ünitelerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarının direnç profilleri: Beş yıllık değerlendirme

Tuna Demirdal, Pınar Şen, Erkan Yula, Selçuk Kaya, Salih Atakan Nemli, Mustafa Demirci

Ortadogu Tıp Derg, Volume 9, Issue 3, pp. 108-112

DOI: https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.265426

Abstract Article (PDF)

ABSTRACT

Aim: Pseudomonas aeruginosa is a non-fermentative Gram-negative bacilli which infections in hospitals have high morbidity and mortality rates. The aim of this study is to determine the antimicrobial susceptibility profiles of P.aeruginosa strains isolated in Izmir Katip Celebi University Ataturk Training and Research Hospital between January 2011 and October 2015.
Materials and Methods: In our hospital, between January 2011- October 2015, 1056 P.aeruginosa strains isolated from various clinical specimens of patients who have been in intensive care units were included in the study. The strains were isolated and identified by the BD Phoenix™ Automated Microbiology System (Becton-Dickinson, USA) system. Antibiotic susceptibilities were established by disk diffusion and were evaluated according to the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) criteria in 2011-2014 and EUCAST criteria in 2015.
Results: The highest antibiotic resistance rates were found for cefoperazone/sulbactam, aztreonam, ceftazidime, piperacillin/ tazobactam and cefepime.
Conclusion: In our hospital, resistance rates of P. aeruginosa strains isolated from intensive care unit were higher consistent with data reported in our country. The results of this study will help the establishment of more appropriate treatment protocols against P.aeruginosa infections and will aid in preventing the development of a high number of resistant strains.

Keywords: Pseudomonas aeruginosa, antimicrobial susceptibility, intensive care unit

ÖZ

Amaç: Pseudomonas cinsi bakteriler doğada yaygın olarak bulunan, fırsatçı enfeksiyonlar ve hastane enfeksiyonlarına yol açan non-fermantatif Gram negatif basillerdir. Hastanelerde özellikle yoğun bakımlarda izole edilen bu etken mekanik ventilatöre bağlı, kemoterapi ve antibiyotik tedavisi alan bağışıklık sistemi baskılanmış hastalarda önemli morbidite ve mortalite nedenidir. Bu çalışmanın amacı yoğun bakım ünitelerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında antibiyotik duyarlılık profilinin belirlenmesidir.
Yöntem: Ocak 2011 – Ekim 2015 tarihleri arasında hastanemizde yoğun bakım ünitelerinde izlenmiş olan hastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen toplam 1056 P.aeruginosa suşu çalışmaya dahil edildi. Suşların tanımlaması ve antibiyogram profili BD Phoenix™ Automated Microbiology System (Becton-Dickinson, Amerika) cihazı kullanılarak 2011-2014 yılları arasında CLSI, 2015 yılında EUCAST önerileri doğrultusunda gerçekleştirildi.
Bulgular: İzolatlarda en yüksek direnç görülen antibiyotikler sırasıyla sefaperazon-sulbaktam, aztreonam, seftazidim, piperasilin-tazobaktam ve sefepim olarak bulundu. Kolistin, amikasin, moksifloksasin, netilmisin ise en duyarlı bulunun antibiyotikler olarak saptandı.
Sonuç: Hastanemizde yoğun bakımlardan izole edilen P.aeruginosa suşlarında direnç oranları ülkemizden bildirilen verilerle uyumlu olarak yüksek bulundu. Her merkezin kendi etken ve antibiyotik duyarlılıklarını takip etmesi; ampirik tedavide yoğun bakım ünitelerinin florasına uygun antibiyotik kombinasyonları seçilmesine, geniş spektrumlu antibiyotiklerin yaygın kullanımının kısıtlanması suretiyle dirençli mikroorganizmaların azaltılmasına katkı sağlayacaktır.

Keywords: Pseudomonas aeruginosa, antimikrobiyal duyarlılık, yoğun bakım