The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients
Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları
Nilgün Altın 1, Salih Cesur 2 * , Göknür Yapar Toros 3, Kamer Koldaş 4, Gülkan Solgun 5, İrfan Şencan 1
1 Dışkapı Yıldırım Beyazıt Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, Ankara, Türkiye
2 Ankara Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, Ankara, Türkiye
3 Dr. Abdurrahman Yurtaslan Onkoloji Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği, Ankara, Türkiye
4 Yenimahalle Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Klinik Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Ankara, Türkiye
5 Dr. Abdurrahman Yurtaslan Onkoloji Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı, Ankara, Türkiye
* Corresponding Author
Ortadogu Tıp Derg, Volume 10, Issue 2, pp. 130-134
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
OPEN ACCESS
Download Full Text (PDF)
Abstract
Aim: The infections caused by candida species are important causes of mortality in intensive care unit (ICU) patients. In this study, we aimed to determine the distributions of candida species and the susceptibilities of these organisms to amphotericin B, flucanazole, flucytosine, and varicozanole retrospectively, which were isolated from various clinical samples of ICU patients at Etlik Education and Research Hospital.
Materials and Method: In this study, a total of 51 Candida species were included that were isolated from urine (n=46, 90%), blood (n=2, 4%), bronchoalveolar lavage fluid (n=2, 4%) and wound cultures (n=1, 2%) of ICU patients between January 2011 and January 2012. Candida species were identified by germ tube test and VITEK 2 Compact System (BioMerieux, France) automatized identification system and their antifungal susceptibilities were determined.
Results: Of these 51 candida species; 26 (51%) were C. albicans, 7 (14%) were C. tropicalis, 5 (10%) were C. parapsilosis, 4 (8%) were C. glabrata, 3 (6%) were C. lusitaniae, 3 (6%) were C. Krusei, 2 (4%) were C. famata and 1 (2%) was C. kefyr. Forty-nine (98%) candida species were investigated for antifungal susceptibility. For flucytosine, 47 (95.9%) species were sensitive whereas 2 C. krusei species were moderately sensitive. For fluconazole, 42 species (85.7%) were sensitive, 6 species (3 C. krusei, 3 C. glabrata) were resistant, and 1 species (C. galibrata) was moderately sensitive. For voricanazole, 48 species (98%) were sensitive, and 1 C. glabrata species was resistant. For amphotericin B, 45 species (91.8%) were sensitive and 4 species (2 C. krusei, 2 C. glabrata) were moderately sensitive.
Conclusion: In intensive care unit patients, identification of Candida species and determination of antifungal susceptibilities is necessary for planning both empirical and agent specific antifungal therapy.
Öz
Amaç: Candida türlerine bağlı infeksiyonlar yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda mortalitenin önemli bir nedenidir. Bu çalışmada, Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitesinde yatan hastaların çeşitli klinik örneklerinden izole edilen candida türlerinin dağılımının ve amfoterisin B, flukonazol, flusitozin ve vorikonazol duyarlılıklarının retrospektif olarak belirlenmesi amaçlandı.
Gereç ve Yöntem: Çalışmada Ocak 2011- Ocak 2012 tarihleri arasında Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi Yoğun Bakım Ünitesi’nde yatan hastaların 46 idrar (90.2), 2 kan (%4 ), 2 (%4)bronkoalveoler lavaj sıvısı ve 1 (%2) yara kültüründen izole edilen toplam 51 Candida suşu çalışmaya alındı. Candida suşları germ tüp testi ve VITEK 2 Compact System (BioMerieux,Fransa) otomatize identifikasyon sistemi ile tanımlandı ve antifungal duyarlılıkları belirlendi.
Bulgular: Toplam 51 Candida suşunun 26 (%51)’sı C.albicans, 7 (%14)’si C. tropicalis, 5 (%10 )’i C. parapsilosis, 4 (%8)’ü C.glabrata, 3 (%6)’ü C. lusitaniae, 3 (%6)’ü C. krusei, 2(%4)’si C. famata ve 1 (%2)’i C.kefyr olarak belirlendi. Kırkdokuz (%96) Candida suşunda antifungal duyarlılık araştırıldı. Flusitozin 47 suşta (%95.9) duyarlı iken, 2 tane C.krusei suşunda orta duyarlı idi. Flukonazol 42 suşta (%85.7) duyarlı iken, 6 suşta dirençli (3’ü C. krusei, 3’ü C.glabrata ), 1 C.glabrata suşunda ise orta duyarlı idi. Vorikonazol 48 suşta (%98) duyarlı iken, 1 C. glabrata suşunda dirençli idi. Amfoterisin B 44 suşta (%90) duyarlı iken, 4 suşun (2’si C. krusei, 2’si C. glabrata) orta duyarlı olduğu tespit edildi.
Sonuç: Yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda Candida türlerinin sıklığının ve antifungal duyarlılıklarının saptanması hem ampirik antifungal tedavinin planlanması hem de etkene spesifik antifungal tedavinin belirlenmesi açısından gereklidir.
- Akalın H. Kandidemilerde risk faktörleri ve risk değerlendirmesi, ANKEM Derg 2008;22:270-4.
- Yapar N. Epidemiology and risk factors for invasive candidiasis. Therapeutics Clin Risk Manag 2014:10 95-105.
- Çalışkan E, Dede A, Güven GB. Kan kültürlerinde saptanan Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. ANKEM Derg 2013;27:25-30.
- Blumberg HM, Jarvis WR, Soucie MJ, Risk Factors for Candidal Bloodstream Infections in Surgical Intensive Care Unit Patients: The NEMIS Prospective Multicenter Study. CID 2001:33;177-86.
- Falagas ME, Roussos N, Vardakas KZ. Relative frequency of albicans and the various non-albicans Candida spp among candidemia isolates from inpatients in various parts of the world: a syste¬matic review. Int J Infect Dis 2010;14:e954-66.
- Grandesso S, Sapino B, Mazzuccato S et al. Study on in vitro susceptibility of Candida spp. isolated from blood culture, Infez Med 2012;20:25-30.
- Jung SI, Shin JH, Song JH, et al and Korean Study Group for Candidemia. Multicenter surveillance of species distribution and antifungal susceptibili¬ties of Candida bloodstream isolates in South Korea, Med Mycol 2010;48:669-74.
- Zer Y, Balcı İ. Yoğun bakım ünitesindeki hastalardan izole edilen candida suşlarının identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2002; 32:230-4.
- Bakir M, Cerikcioglu N, Barton R, Yagci A. Epidemiology of candidemia in a Turkish tertiary care hospital, APMIS 2006;114:601-10.
- Gültekin B, Eyigör M, Telli M, Aksoy M, Aydın N. Yedi yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin retrospektif olarak incelenmesi, ANKEM Derg 2010;24:202-8.
- Öztürk T, Özseven AG, Sesli Çetin E, Kaya S. Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarının tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması, Kocatepe Tıp Derg 2013;14:17-22.
- Pelit S, Uzun M. Yoğun bakım unitelerinde yatan hastalara ait ceşitli klinik orneklerden izole edilen candida suşlarında tür dağılımının ve antifungal duyarlılıkların araştırılması. Yoğun Bakım Derg 2016;7:49-52.
- Cıtak S, Cesur S, Özcelik B,Abbasoğlu U. In vitro susceptibility of Candida species isolated from blood culture to some antifungal agents. Jpn J Infect Dis 2005;58;44-6.
- Yuksekkaya Ş, Fındık D, Arslan U. Yoğun bakım unitesinde yatan hastaların idrarlarından izole edilen Candida türlerinin molekuler epidemiyolojisi ve antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul 2011; 45:137-49.
Citation
Altın N, Cesur S, Yapar Toros G, Koldaş K, Solgun G, Şencan İ. The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients. Ortadogu Tıp Derg. 2018;10(2):130-4.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
Altın, N., Cesur, S., Yapar Toros, G., Koldaş, K., Solgun, G., & Şencan, İ. (2018). The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients.
Ortadoğu Tıp Dergisi, 10(2), 130-134.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
Altın, N., Cesur, S., Yapar Toros, G., Koldaş, K., Solgun, G., and Şencan, İ. (2018). The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients.
Ortadoğu Tıp Dergisi, 10(2), pp. 130-134.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
Altın N, Cesur S, Yapar Toros G, Koldaş K, Solgun G, Şencan İ. The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients.
Ortadogu Tıp Derg. 2018;10(2), 130-134.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
Altın, Nilgün, Salih Cesur, Göknür Yapar Toros, Kamer Koldaş, Gülkan Solgun, and İrfan Şencan. "The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients".
Ortadoğu Tıp Dergisi 2018 10 no. 2 (2018): 130-134.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948
Altın, Nilgün et al. "The distrubution and antifungal susceptibilities of candida species isolated from clinical samples of intensive care unit patients".
Ortadoğu Tıp Dergisi, vol. 10, no. 2, 2018, pp. 130-134.
https://doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.277948